يلجأ البعض لعملية الحقن المجهري كأحد طرق علاج العقم أو تأخر الإنجاب؛ لذا يعرض استشاري النساء والتوليد د. صبحي هيكل، الحالات التي ينبغي فيها اللجوء للحقن المجهري أو أطفال الأنابيب وهي:
-إصابة الزوجة بمرض بطانة الرحم المهاجرة
-انسداد إحدى قنوات فالوب أو القناتين معاً
-تأخر الحمل غير معروف السبب
-فشل محاولات الإخصاب المساعد الأخرى مثل التلقيح الصناعي
-تكيس المبايض
-ضعف شديد في الحيوانات المنوية من حيث الحركة والعدد
-إذا رغب الزوجين في تحديد نوع الجنين حيث أن تحديد نوع الجنين متاح فقط من خلال الحقن المجهري أو أطفال الأنابيب.
-إذا رغب الزوجين في عمل فحص وراثي مبكر للأجنة نتيجة لوجود أمراض وراثية عند أحد الزوجين أو كلاهما أو حتى ولادة أطفال ذو عيوب خلقية من قبل